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    我國自主研發(fā)第三代基因測序儀成功用于NIPT

    [2017/11/3]

        近日,由南方科技大學(xué)、中國科學(xué)院北京基因組研究所、浙江大學(xué)醫學(xué)院附屬婦產(chǎn)科醫院(以下簡(jiǎn)稱(chēng)“浙大婦產(chǎn)科醫院”)等多家單位聯(lián)合完成的“第三代單分子測序儀的無(wú)創(chuàng )產(chǎn)前檢測研究”結果顯示,使用我國完全自主研發(fā)的第三代單分子基因測序儀,可成功應用于無(wú)創(chuàng )產(chǎn)前檢測(英文簡(jiǎn)稱(chēng)NIPT),且檢測結果100%準確。相關(guān)研究成果已發(fā)表在由非營(yíng)利機構美國冷泉港實(shí)驗室運營(yíng)的BioRxiv網(wǎng)站上。
     
      “這是世界上首次利用單分子測序技術(shù)進(jìn)行NIPT臨床檢測并獲得成功的案例!敝袊茖W(xué)院北京基因組研究所研究員、項目測序技術(shù)負責人于軍說(shuō),作為中國第三代基因測序技術(shù)研究在國際研究領(lǐng)域的一次引領(lǐng)性重大突破和原創(chuàng )成果,這項研究“將實(shí)質(zhì)性地開(kāi)啟健康與醫療體系的個(gè)體化時(shí)代”。
     
      目前,基于二代測序的NIPT還存在著(zhù)一些不足,如檢測胎兒18-三體綜合征(愛(ài)德華氏綜合征)及13-三體綜合征(帕陶氏綜合征)的假陽(yáng)性率還明顯高于21-三體綜合征,胎兒性染色體異常以及微缺失、微重復檢測的準確性有待提高等。
     
      論文第一作者、項目臨床負責人、浙大婦產(chǎn)科醫院主任醫師董旻岳表示,三代測序儀摒棄了二代測序的PCR擴增環(huán)節,不受GC偏好影響,在保證了21-三體的精確檢測基礎上,對18-、13-三體綜合征的檢出率更高,可有效降低假陽(yáng)性率。此外,使用二代基因測序儀做NIPT,至少需要在孕12周后才能獲得比較準確的檢測結果,相比之下,三代基因測序儀靈敏度更高,可檢測的cffDNA(母體血漿中存在胎兒游離DNA)濃度低至2%,使得NIPT的檢測時(shí)間有可能被提前至孕8周。這無(wú)疑有利于及早發(fā)現、及早處置,將為臨床診治爭取到更多寶貴的時(shí)間。
     
      董旻岳同時(shí)表示,三代測序技術(shù)還有望提高胎兒性染色體異常、微缺失、微重復無(wú)創(chuàng )檢測的靈敏度,拓寬NIPT檢測的疾病譜。
     
      在10月26日~29日于深圳舉行的第12屆基因組學(xué)國際會(huì )議上,美國梅奧醫學(xué)中心教授David Smith在其報告中提出,美國Illumina 公司基因測序儀全球壟斷的現狀會(huì )帶來(lái)諸多問(wèn)題,如科研及醫療機構缺乏選擇、試劑成本居高不下等。對此,于軍認為,本項研究的成功是基因測序領(lǐng)域的重大利好,意味著(zhù)我國自主研發(fā)的第三代基因測序儀將打破美國Illumina公司在NIPT領(lǐng)域一家獨大局面的未來(lái)可期。
     
      據介紹,該項目所使用的第三代基因測序平臺是由深圳市瀚;蛏锟萍加邢薰(下簡(jiǎn)稱(chēng)“瀚;颉)今年7月宣布研發(fā)成功并投入小批量樣機生產(chǎn)、擁有完全自主知識產(chǎn)權的第三代單分子基因測序儀GenoCare。中國科學(xué)院院士陳潤生評價(jià)說(shuō),基于GenoCare的NIPT研究獲得成功,證明了無(wú)需擴增就可以實(shí)現NIPT,這是重大的技術(shù)創(chuàng )新,是中國基因測序技術(shù)研究領(lǐng)域一次真正意義上的彎道超車(chē)。
     
      南方科技大學(xué)副教授、瀚;蚨麻L(cháng)賀建奎告訴記者,第三代基因測序儀及試劑的完全國產(chǎn)化可使檢測成本大幅下降并遠低于二代測序儀,此外專(zhuān)門(mén)為臨床進(jìn)行的設計也使操作更為方便,這些優(yōu)點(diǎn)都令三代測序儀便于大規模普及。未來(lái),除了NIPT,第三代單分子基因檢測技術(shù)還有望應用于單基因病、ctDNA腫瘤早篩、傳染病檢測、農業(yè)育種、法醫鑒定等方面。

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