產(chǎn)品分類(lèi)
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實(shí)驗室儀器
按功能分
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- 8. 破碎、研磨、均質(zhì)儀器
- 9. 消解
- 計量?jì)x器
- 培養孵育設備
- 基礎通用設備
- 通用分析儀器
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- 電化學(xué)分析類(lèi)
- 其他
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按專(zhuān)業(yè)實(shí)驗室分- 化學(xué)合成
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生物學(xué)家提議開(kāi)展“地球生物基因組計劃”
[2017/3/9]
基因測序是一種新型基因檢測技術(shù),能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列;驕y序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實(shí)驗室研究演變到臨床使用,可以說(shuō)基因測序技術(shù),是下一個(gè)改變世界的技術(shù)。
說(shuō)到基因測序,理想主義者喜歡拋出一對大數據:例如英國生物庫計劃解譯50萬(wàn)人的基因組,冰島計劃研究該國所有人的基因組。2月23日,在由美國史密森尼生物多樣性基因組學(xué)計劃和中國深圳華大基因共同組織的一次會(huì )議上,一小群研究人員甚至將賭注押得更高:宣布他們計劃最終對"地球上的所有生命"進(jìn)行測序。
他們的計劃被稱(chēng)作地球生物基因組計劃(EBP),目前尚未收到任何具體資助,且可能至少耗費數十億美元。加州大學(xué)戴維斯分校進(jìn)化生物學(xué)家Harris Lewin是該群體的成員,他們在兩年前有了這個(gè)設想,Lewin表示EBP可通過(guò)聚焦真核生物--包括所有植物、動(dòng)物和單細胞有機物如變形蟲(chóng)的有機物群體,在實(shí)現其大膽的目標上邁出第一步。
這一戰略和EBP的整體概念在2017年生物基因組學(xué)會(huì )議上遇到了知音,這是近日保護生物學(xué)家、進(jìn)化生物學(xué)家、系統生物學(xué)家和其他對工作中應用基因組學(xué)感興趣的生物學(xué)家進(jìn)行的一次集會(huì )。"這是一個(gè)非常好的想法。"加州圣迭戈動(dòng)物園自然保護研究所保護生物學(xué)家Oliver Ryder說(shuō),"如果我們真的想了解生命如何演化,基因組生物學(xué)將是其中的一部分。"
Ryder和一些人將EBP和人類(lèi)基因組計劃進(jìn)行對比,后者在30多年前一開(kāi)始也是一項雄心勃勃、充滿(mǎn)爭議、在技術(shù)上貌似不可實(shí)現的項目。然而,相關(guān)工作最終不僅測出了首個(gè)人類(lèi)基因組序列,還開(kāi)發(fā)了處于醫學(xué)前沿的許多全新DNA技術(shù),并成為價(jià)值200億美元的產(chǎn)業(yè)的基礎。Lewin說(shuō):"人們已經(jīng)從人類(lèi)基因組經(jīng)驗中了解到它(測序)在生物學(xué)上是一個(gè)巨大的進(jìn)步。"
目前,EBP的許多細節仍在研究之中。但正如現在提出的,第一步將是詳細地測量真核生物家族(總體約有9000個(gè))每個(gè)成員的DNA,從而建立標準參照基因組或比人類(lèi)基因組更好的參照。下一步將是對每類(lèi)包含15萬(wàn)至20萬(wàn)屬種的物種進(jìn)行測序。最終,EBP參試者將獲得已知真核物種的150萬(wàn)個(gè)基因組。EBP組織者、行為遺傳學(xué)家、伊利諾伊大學(xué)卡爾·伍斯基因組生物學(xué)研究所所長(cháng)Gene Robinson說(shuō),這些低分辨率基因組可以根據需要通過(guò)將其與家族參照進(jìn)行對比或進(jìn)行更多測序而得到提升。
Lewin、Robinson和EBP共同組織者、史密森尼國家自然歷史博物館進(jìn)化生物學(xué)家John Kress估測,整個(gè)真核生物測序工作的花費可能相當于首個(gè)人類(lèi)基因組測序的花費。彼時(shí),讀取和整理構成人類(lèi)基因組的30億個(gè)堿基花費了約27億美元,這在今天相當于48億美元。其組織者表示,如果有相當可觀(guān)的資助,那么EBP的真核生物研究可能在10年之內完成。
這樣的樂(lè )觀(guān)態(tài)度源于DNA測序成本的不斷下降,來(lái)自加州山景城完美基因公司的一名報告人稱(chēng),該公司打算在一年內花費約100美元粗略繪制整個(gè)真核生物基因組序列。同時(shí),測序技術(shù)的不斷提高也使得研究人員用更合理的價(jià)格測出更高質(zhì)量的基因組成為可能。Lewin說(shuō):"這在某種程度上非常明確,對地球上所有生物進(jìn)行測序是可能的。"
盡管一些人可能覺(jué)得研究人員沒(méi)有把數十億美元花費在人類(lèi)研究、物質(zhì)基礎研究或神秘宇宙研究上有些不合理,但由于若干研究學(xué)界在追逐其雄心勃勃的測序計劃,EBP已經(jīng)產(chǎn)生了有利的開(kāi)端。這包括"基因組10K計劃",它旨在測量1萬(wàn)個(gè)脊椎動(dòng)物的基因組序列,包括每個(gè)種屬內的一個(gè)物種;"i5K"計劃,它旨在解譯5000種節肢動(dòng)物基因組序列;"B10K"計劃,它旨在對10500個(gè)鳥(niǎo)類(lèi)物種進(jìn)行基因組測序。EBP將幫助協(xié)調、編纂以及資助這些研究。"EBP概念是涵蓋所有學(xué)術(shù)界的一個(gè)學(xué)術(shù)界。"Lewin說(shuō)。
此外,還有來(lái)自基因組學(xué)領(lǐng)域巨頭的貢獻,比如中國的華大基因、英國的惠康信托桑格研究所等。但在近日的計劃會(huì )議上,EBP面臨的嚴峻挑戰非常清晰,甚至超過(guò)了資金的范疇。盡管來(lái)自巴西、中國和英國的研究人員表示他們的國家在某種程度上都非?释麉⑴c,但參與會(huì )議的20人均強調加強國際化程度的必要性,包括發(fā)展中國家尤其是那些擁有豐富生物多樣性國家的參與將會(huì )影響該計劃的最終結果。他們提議EBP幫助那些地區測序、培訓技術(shù)專(zhuān)家及夯實(shí)其相關(guān)能力。哥本哈根丹麥自然歷史博物館進(jìn)化生物學(xué)家Thomas Gilbert說(shuō), 全球基因組生物多樣性網(wǎng)絡(luò )(GGBN)正在編輯來(lái)自全球博物館和其他生物庫的清單和標本圖像,這將會(huì )提供所需要的許多DNA,但仍需要更廣泛的參與。
Lewin對該計劃非常樂(lè )觀(guān)。 他在2017生物基因組學(xué)會(huì )議閉幕發(fā)言中描述了EBP的輪廓之后,被研究人員團團圍住,他們渴望知道自己可以做些什么。"設法將這些'部落'聚在一起非常好。"佛羅里達諾瓦東南大學(xué)生物學(xué)家Jose Lopez說(shuō),他的"部落"已經(jīng)啟動(dòng)GIGA--旨在對7000種海洋無(wú)脊椎動(dòng)物進(jìn)行測序的一個(gè)項目。"這是一個(gè)大計劃。我們需要很多技能和許多做實(shí)事的人。"
說(shuō)到基因測序,理想主義者喜歡拋出一對大數據:例如英國生物庫計劃解譯50萬(wàn)人的基因組,冰島計劃研究該國所有人的基因組。2月23日,在由美國史密森尼生物多樣性基因組學(xué)計劃和中國深圳華大基因共同組織的一次會(huì )議上,一小群研究人員甚至將賭注押得更高:宣布他們計劃最終對"地球上的所有生命"進(jìn)行測序。
他們的計劃被稱(chēng)作地球生物基因組計劃(EBP),目前尚未收到任何具體資助,且可能至少耗費數十億美元。加州大學(xué)戴維斯分校進(jìn)化生物學(xué)家Harris Lewin是該群體的成員,他們在兩年前有了這個(gè)設想,Lewin表示EBP可通過(guò)聚焦真核生物--包括所有植物、動(dòng)物和單細胞有機物如變形蟲(chóng)的有機物群體,在實(shí)現其大膽的目標上邁出第一步。
這一戰略和EBP的整體概念在2017年生物基因組學(xué)會(huì )議上遇到了知音,這是近日保護生物學(xué)家、進(jìn)化生物學(xué)家、系統生物學(xué)家和其他對工作中應用基因組學(xué)感興趣的生物學(xué)家進(jìn)行的一次集會(huì )。"這是一個(gè)非常好的想法。"加州圣迭戈動(dòng)物園自然保護研究所保護生物學(xué)家Oliver Ryder說(shuō),"如果我們真的想了解生命如何演化,基因組生物學(xué)將是其中的一部分。"
Ryder和一些人將EBP和人類(lèi)基因組計劃進(jìn)行對比,后者在30多年前一開(kāi)始也是一項雄心勃勃、充滿(mǎn)爭議、在技術(shù)上貌似不可實(shí)現的項目。然而,相關(guān)工作最終不僅測出了首個(gè)人類(lèi)基因組序列,還開(kāi)發(fā)了處于醫學(xué)前沿的許多全新DNA技術(shù),并成為價(jià)值200億美元的產(chǎn)業(yè)的基礎。Lewin說(shuō):"人們已經(jīng)從人類(lèi)基因組經(jīng)驗中了解到它(測序)在生物學(xué)上是一個(gè)巨大的進(jìn)步。"
目前,EBP的許多細節仍在研究之中。但正如現在提出的,第一步將是詳細地測量真核生物家族(總體約有9000個(gè))每個(gè)成員的DNA,從而建立標準參照基因組或比人類(lèi)基因組更好的參照。下一步將是對每類(lèi)包含15萬(wàn)至20萬(wàn)屬種的物種進(jìn)行測序。最終,EBP參試者將獲得已知真核物種的150萬(wàn)個(gè)基因組。EBP組織者、行為遺傳學(xué)家、伊利諾伊大學(xué)卡爾·伍斯基因組生物學(xué)研究所所長(cháng)Gene Robinson說(shuō),這些低分辨率基因組可以根據需要通過(guò)將其與家族參照進(jìn)行對比或進(jìn)行更多測序而得到提升。
Lewin、Robinson和EBP共同組織者、史密森尼國家自然歷史博物館進(jìn)化生物學(xué)家John Kress估測,整個(gè)真核生物測序工作的花費可能相當于首個(gè)人類(lèi)基因組測序的花費。彼時(shí),讀取和整理構成人類(lèi)基因組的30億個(gè)堿基花費了約27億美元,這在今天相當于48億美元。其組織者表示,如果有相當可觀(guān)的資助,那么EBP的真核生物研究可能在10年之內完成。
這樣的樂(lè )觀(guān)態(tài)度源于DNA測序成本的不斷下降,來(lái)自加州山景城完美基因公司的一名報告人稱(chēng),該公司打算在一年內花費約100美元粗略繪制整個(gè)真核生物基因組序列。同時(shí),測序技術(shù)的不斷提高也使得研究人員用更合理的價(jià)格測出更高質(zhì)量的基因組成為可能。Lewin說(shuō):"這在某種程度上非常明確,對地球上所有生物進(jìn)行測序是可能的。"
盡管一些人可能覺(jué)得研究人員沒(méi)有把數十億美元花費在人類(lèi)研究、物質(zhì)基礎研究或神秘宇宙研究上有些不合理,但由于若干研究學(xué)界在追逐其雄心勃勃的測序計劃,EBP已經(jīng)產(chǎn)生了有利的開(kāi)端。這包括"基因組10K計劃",它旨在測量1萬(wàn)個(gè)脊椎動(dòng)物的基因組序列,包括每個(gè)種屬內的一個(gè)物種;"i5K"計劃,它旨在解譯5000種節肢動(dòng)物基因組序列;"B10K"計劃,它旨在對10500個(gè)鳥(niǎo)類(lèi)物種進(jìn)行基因組測序。EBP將幫助協(xié)調、編纂以及資助這些研究。"EBP概念是涵蓋所有學(xué)術(shù)界的一個(gè)學(xué)術(shù)界。"Lewin說(shuō)。
此外,還有來(lái)自基因組學(xué)領(lǐng)域巨頭的貢獻,比如中國的華大基因、英國的惠康信托桑格研究所等。但在近日的計劃會(huì )議上,EBP面臨的嚴峻挑戰非常清晰,甚至超過(guò)了資金的范疇。盡管來(lái)自巴西、中國和英國的研究人員表示他們的國家在某種程度上都非?释麉⑴c,但參與會(huì )議的20人均強調加強國際化程度的必要性,包括發(fā)展中國家尤其是那些擁有豐富生物多樣性國家的參與將會(huì )影響該計劃的最終結果。他們提議EBP幫助那些地區測序、培訓技術(shù)專(zhuān)家及夯實(shí)其相關(guān)能力。哥本哈根丹麥自然歷史博物館進(jìn)化生物學(xué)家Thomas Gilbert說(shuō), 全球基因組生物多樣性網(wǎng)絡(luò )(GGBN)正在編輯來(lái)自全球博物館和其他生物庫的清單和標本圖像,這將會(huì )提供所需要的許多DNA,但仍需要更廣泛的參與。
Lewin對該計劃非常樂(lè )觀(guān)。 他在2017生物基因組學(xué)會(huì )議閉幕發(fā)言中描述了EBP的輪廓之后,被研究人員團團圍住,他們渴望知道自己可以做些什么。"設法將這些'部落'聚在一起非常好。"佛羅里達諾瓦東南大學(xué)生物學(xué)家Jose Lopez說(shuō),他的"部落"已經(jīng)啟動(dòng)GIGA--旨在對7000種海洋無(wú)脊椎動(dòng)物進(jìn)行測序的一個(gè)項目。"這是一個(gè)大計劃。我們需要很多技能和許多做實(shí)事的人。"