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實(shí)驗室儀器
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總結人類(lèi)基因組計劃的經(jīng)驗教訓
[2015/10/12]
人類(lèi)基因組測序,在今天看來(lái)是小菜一碟,但放在25年前,實(shí)在是一個(gè)大膽的計劃。人類(lèi)基因組計劃(HGP)在1990年啟動(dòng),并在13年的時(shí)間內完成了人類(lèi)基因組測序的創(chuàng )舉。近日,三位頂級科學(xué)家在《Nature》雜志上撰文,談?wù)摿巳祟?lèi)基因組計劃的經(jīng)驗和教訓。
這三位科學(xué)家分別是:Eric Green,美國國家人類(lèi)基因組研究所的所長(cháng);James Watson,冷泉港實(shí)驗室的名譽(yù)主席;以及Francis Collins,美國國立衛生研究院的院長(cháng)。想當年,這三個(gè)機構聯(lián)合國際上多個(gè)機構開(kāi)展了人類(lèi)基因組計劃。他們在文中總結了HGP的六個(gè)經(jīng)驗教訓。
首先,這種工作鼓勵研究人員去接受伙伴關(guān)系,而打破了研究人員單獨工作的常態(tài)。HGP匯集了來(lái)自不同國家、不同學(xué)科的2000多名研究人員。Green、Watson和Collins指出,成功來(lái)源于強大的領(lǐng)導、對任務(wù)重要性的認知,以及研究人員愿意放棄個(gè)人成就而實(shí)現集體利益。
人類(lèi)基因組計劃也最大限度地提高了數據共享。在大量的基因組圖譜和序列數據生成之后,勢必要迅速建立政策,以縮短數據生成和發(fā)布之間的時(shí)間。這些努力最終促成了1996年百慕大原則的通過(guò)。不過(guò),他們認為,廣泛的數據共享也面臨一些新的挑戰,包括分析和移動(dòng)大量數據的困難,以及如何保護參與者的隱私等。
與此相關(guān),三位科學(xué)家認為HGP的一個(gè)缺陷在于對數據分析的計劃不夠。第一個(gè)人類(lèi)基因組序列是零零碎碎地產(chǎn)生的,需要拼在一起。在項目后期,這種計算過(guò)程的需求就變得愈加明顯。對于千人基因組計劃和癌癥基因組圖譜等近期項目,他們吸取教訓,盡早計劃。
Green、Watson和Collins指出,HGP強調了技術(shù)開(kāi)發(fā)。事實(shí)上,這個(gè)項目催化了眾多關(guān)鍵基因組技術(shù)的開(kāi)發(fā),也帶來(lái)了分子生物學(xué)、化學(xué)、物理學(xué)等學(xué)科的創(chuàng )新。多個(gè)改進(jìn)相結合,實(shí)現了革命性的進(jìn)步,如基于毛細管的DNA測序儀。從一開(kāi)始就培育技術(shù)創(chuàng )新,這對今天的大型項目同樣重要。
HGP計劃也考慮了科學(xué)進(jìn)步的社會(huì )影響。它的發(fā)起人認為,繪制和測序人類(lèi)基因組所獲得的信息可能對社會(huì )產(chǎn)生深遠的影響。因此,HGP成為首個(gè)大型研究項目,包含了專(zhuān)門(mén)研究社會(huì )問(wèn)題的部分,比如怎么保護人們的隱私以及防止歧視。
最后,Green、Watson和Collins表示,HGP的成功在于領(lǐng)導者開(kāi)明的態(tài)度和定期的調整。他們認為,那些有著(zhù)大膽目標的大型項目也能獲得成功,只要整體目標是建立在明確的階段性目標、質(zhì)量指標和評估之上的。
在90年代初期,人們根據沒(méi)有預料到,HGP的主要遺產(chǎn)是以一種全新的方式來(lái)開(kāi)展科學(xué)研究!叭祟(lèi)基因組計劃的故事帶來(lái)了一些寶貴的提醒,其中一些進(jìn)展無(wú)疑會(huì )觸發(fā)研究方式的根本改變,”這三位科學(xué)家寫(xiě)道。