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    美國研發(fā)新型廉價(jià)DNA測序儀 可實(shí)時(shí)驗證身份

    [2017/12/7]

    據美國科學(xué)促進(jìn)會(huì )(AAAS)科技新聞共享平臺EurekAlert!日前報道，美國哥倫比亞大學(xué)和紐約基因中心研究人員開(kāi)發(fā)出了一種廉價(jià)的DNA測序儀，將其和定制軟件匹配應用，可讓實(shí)時(shí)DNA驗證身份成為現實(shí)。
     

    　　研究團隊在最新一期《eLife》雜志上刊文稱(chēng)，這項技術(shù)應用廣泛，可以識別大規模災難中的受害者，分析犯罪現場(chǎng)采集的物證，最直接的用途是在癌癥實(shí)驗中識別出錯誤標記或污染了的細胞系。
     
    　　以往的基因測序是利用一種信用卡大小的名為MinION的儀器，通過(guò)微孔讀取核苷酸序列，但因錯誤率高等因素，多用于研究細菌和病毒，在人類(lèi)細胞中使用仍受限。
     
    　　現在，研究人員進(jìn)一步創(chuàng )新，將造價(jià)僅1000美元的MinION與在線(xiàn)人類(lèi)基因數據密切結合，以接近完美的準確度驗證人類(lèi)和細胞的身份。MinION首先對隨機DNA序列排序，從中選擇個(gè)性化的變體，然后使用貝葉斯算法隨機比較變體混合物，與已存其他文件上的遺傳圖譜中變體比較，通過(guò)每次交叉檢查，迅速縮小搜索范圍。
     
    　　研究人員報告說(shuō)，他們利用該方法將一份面部細胞樣本與公共數據庫DNA.land上的3.1萬(wàn)基因組參考數據對比，對變體進(jìn)行交叉核對，幾分鐘之內，就輕松驗證出該團隊第一作者索菲·查愛(ài)杰的身份。團隊其他人員和哥倫比亞大學(xué)學(xué)生在各種基因組學(xué)課程中，也以同樣的方式進(jìn)行了初步測序，結果準確可靠。
     
    　　這種交叉數據重新識別技術(shù)稱(chēng)為“MinION素描”，其作為廉價(jià)的細胞認證工具，可以最先迅速應用于實(shí)驗研究。此前科研機構呼吁，因缺乏自行驗證細胞系所需的昂貴機器，大多數醫學(xué)研究人員要么跳過(guò)驗證，要么送到專(zhuān)門(mén)實(shí)驗室，延遲了重要的發(fā)現和治療，而新技術(shù)解決了由此造成的資金浪費問(wèn)題。
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