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    Illumina“快”布局,聯(lián)合IBM攻克腫瘤精準醫學(xué)壁壘

    [2017/1/11]

    1月10日,測序巨頭Illumina宣布了與皇家飛利浦、IBM的合作協(xié)議,旨在共同推進(jìn)癌癥基因組數據的分析和解釋。從合作的內容來(lái)看,雙方的最終目的是“快”——快速解讀數據,幫助研究人員快速實(shí)現腫瘤精準醫療。
     
      1月10日,Illumina推出最新測序儀NovaSeq系統的消息刷爆了朋友圈,該系統最引人注目的特點(diǎn)莫過(guò)于將基因組測序價(jià)格降低至100美元。該系統的使用場(chǎng)景為基因組測序、液體活檢、腫瘤/正常組織對照測序、群體基因組測序(PopSeq),為比對腫瘤-健康組織的超級深度測序(ultra-deep sequencing)、與復雜疾病相關(guān)的大規;蜃儺惙治龅阮I(lǐng)域提供全新的市場(chǎng)。
     

      也在1月10日,Illumina在腫瘤精準醫療領(lǐng)域做了另外的兩個(gè)布局,宣布了與皇家飛利浦、IBM的合作協(xié)議,旨在共同推進(jìn)癌癥基因組數據的分析和解釋。從合作的內容來(lái)看,雙方的最終目的是“快”——快速解讀數據,快速實(shí)現腫瘤精準醫療。
     
      攜手飛利浦,在全球醫療系統中推廣Illumina測序系統  Illumina與皇家飛利浦戰略合作的目標是將Illumina的測序系統和飛利浦的 IntelliSpace Genomics臨床信息平臺整合,并協(xié)調營(yíng)銷(xiāo)和銷(xiāo)售的解決方案。
     
      基因組數據將在Illumina的NGS數據管理和分析的云基因組計算環(huán)境(BaseSpace Sequence Hub)中產(chǎn)出,并利用飛利浦的 IntelliSpace Genomics腫瘤解決方案進(jìn)行加工,該解決方案的數據包含了放射科、免疫組織化學(xué)、數字化病理學(xué)、醫療記錄和實(shí)驗室檢測。采用該解決方案的實(shí)驗室將獲得先進(jìn)的分析方法、深度學(xué)習技術(shù)、文獻以及其他指南指導等。
     
      此外,飛利浦和Illumina計劃在臨床研究中開(kāi)展合作,共同推進(jìn)腫瘤精準醫學(xué)的進(jìn)程。飛利浦Connected Care and Health Informatics 首席執行官Jeroen Tas在一份聲明中表示,至今大多數使用基因組數據來(lái)輔助癌癥精準診斷和提高治療只在學(xué)術(shù)領(lǐng)域中得以實(shí)現。通過(guò)與Illumina的合作,我們將為更多的實(shí)驗室和護理提供者揭開(kāi)基因組學(xué)的價(jià)值,幫助他們以更快的速度來(lái)推進(jìn)基因組計劃,并為患者提供更精準的藥物,實(shí)現更加有效的治療。
     
      Illumina首席執行官Francis deSouza在一份聲明中補充道,“我們相信這種合作將為Illumina的下一代測序系統納入美國甚至世界醫療衛生系統提供優(yōu)良的路徑!
     
      攜手IBM,快速生成基因組改變的注釋報告
     

      另外,IBM和Illumina計劃將 Watson for Genomics和Illumina的BaseSpace相整合,旨在腫瘤測序過(guò)程中標準化和簡(jiǎn)化基因組數據的解讀。
     
      研究人員使用Illumina的TruSight Tumor 170 癌癥測序panel將獲得有助于解釋變量數據的信息。尤其是Watson for Genomics 將讀取TruSight Tumor 170生成的遺傳信息文件,梳理專(zhuān)業(yè)指南、醫學(xué)文獻、臨床試驗標準、基因組變化的其他來(lái)源信息,該系統將在數分鐘內生成包含每個(gè)基因組改變的注釋報告。
     
      每個(gè)月將增加10000篇科學(xué)論文數據和100個(gè)新臨床試驗數據的Watson for Genomics軟件,將在今年初為 TruSight Tumor 170提供支持,也就是說(shuō)使用TruSight Tumor 170的Watson for Genomics軟件將于今年初上市。
     
      Illumina腫瘤學(xué)副總裁在一份聲明中表示,為了能夠在大范圍內實(shí)現精準醫療,我們需要新的工具來(lái)克服基因組研究的數據分析壁壘。聯(lián)合Illumina的方法與Watson的強大力量,我們希望能夠在很快的周期內生成基因組變化的報告。
     
      IBM Watson Health總經(jīng)理DiSanzo在一份聲明中表示,這次合作為更加系統化的腫瘤基因組學(xué)研究提供了基礎。使用Illumina系統來(lái)獲取寶貴的基因組信息,再由Wasrson系統進(jìn)行可靠的、標準化的基因組解釋?zhuān)覀兿M軌驇椭芯咳藛T快速實(shí)現腫瘤精準醫療。

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