新成果：5小時(shí)可創(chuàng )建脂類(lèi)串聯(lián)質(zhì)譜譜庫

　　該軟件被稱(chēng)為L(cháng)ipidBlast，是由Oliver Fiehn和他的同事們在加州大學(xué)研發(fā)的。Davis去年在《Nature Methods》雜志發(fā)表了一篇論文將此軟件首次公開(kāi)。LipidBlast創(chuàng )建一個(gè)特定類(lèi)別脂質(zhì)的質(zhì)譜庫的步驟是：首先，分析這類(lèi)脂質(zhì)中已知成員的化學(xué)結構。然后，使用這些信息來(lái)推測具有相似結構的此類(lèi)物質(zhì)的其它可能成員。接下來(lái)，此軟件將部分已知成員的化學(xué)結構與之前研究得到的已知成員的串聯(lián)質(zhì)譜數據相關(guān)聯(lián)。最后，它利用這些關(guān)系來(lái)確定含有已推測成員在內的所有其余成員的MS/MS譜圖，包括母離子和子離子。一經(jīng)驗證，通過(guò)對比實(shí)驗數據和檢索MS/MS譜庫，得到的譜庫就可以用于鑒別LC-MS/MS分析的生物樣品中的這些物質(zhì)。

此軟件靈活性很強

　　由于脂類(lèi)在串聯(lián)質(zhì)譜中容易形成可預知的碎片，所以尤其適合此軟件電腦譜庫的創(chuàng )建。而且，LipidBlast非常靈活，足以應付推測正、負離子下或不同的外加電壓下的MS/MS譜圖。在建立譜庫時(shí)，這種靈活性使得它能夠利用40種高或低分辨率質(zhì)譜儀的譜圖，包括三重四極桿質(zhì)譜儀和傅里葉變換質(zhì)譜儀。

　　Fiehn和他的同事利用LipidBlast 建立了一個(gè)基本演示MS/MS譜庫，包含212,516張譜圖，覆蓋26種脂類(lèi)物質(zhì)的119,200種化合物。這些化合物包括磷脂類(lèi)、甘油脂類(lèi)、細菌脂聚糖類(lèi)和植物糖脂類(lèi)。他們已經(jīng)使用這個(gè)庫來(lái)識別了藻類(lèi)、有鞭毛的原生生物和哺乳動(dòng)物干細胞中的脂質(zhì)。

能應對低磷水平的脂類(lèi)家族

　　最近，Fiehn已將注意力轉移到了一類(lèi)特殊的脂類(lèi)−葡萄糖醛酸糖脂(glucuronosyldiacylglycerol，GlcADG)。它是近期日本科學(xué)家從植物中發(fā)現的一種脂類(lèi)。由于GlcADG可以代替植物細胞膜上的磷脂，所以可以幫助植物應對低磷水平。雖然這種脂類(lèi)首先在植物中發(fā)現，但它也可能出現在細菌、真菌和藻類(lèi)等其他生物中。

　　為了與最初發(fā)現這類(lèi)脂質(zhì)的日本科學(xué)家們一起在其它有機體中尋找這類(lèi)脂質(zhì)，Fiehn和他的一位同事使用LipidBlast創(chuàng )建了一個(gè)GlcADG類(lèi)的MS/MS質(zhì)譜庫。照例，這需要利用日本科學(xué)家先前得到的MS/MS譜圖和植物中GlcADG類(lèi)物質(zhì)的化學(xué)結構，以及相似脂類(lèi)成員的化學(xué)結構。最終的譜庫包含15,000 張MS/MS譜圖，建成僅耗時(shí)5小時(shí)。

　　“這項工作不僅有希望通過(guò)GlcADG來(lái)擴展已知有機體的范圍，而且也從另一個(gè)方面體現了LipidBlast快速創(chuàng )建MS/MS譜庫的能力”，Fiehn說(shuō)。他們還開(kāi)發(fā)了應用于新型脂類(lèi)的免費模板，用來(lái)鼓勵其他研究人員使用這款軟件。