盤(pán)點(diǎn)近期最熱的基因組測序新成果

　　種屬：蘭花(Phalaenopsis equestris)

　　基因組：約1.2billionbp

　　我國研究團隊于十一月二十四日在Nature Genetics雜志上發(fā)布了小蘭嶼蝴蝶蘭(Phalaenopsis equestris)的基因組序列。這是一種廣泛用于雜交育種的蘭花品種，基因組含有29，431個(gè)蛋白編碼基因。這一成果為進(jìn)一步的蘭花生物學(xué)研究奠定了基礎。

　　該項目由清華大學(xué)深圳研究生院黃來(lái)強教授和國家蘭科植物種質(zhì)資源保護中心暨深圳市蘭科植物保護研究中心劉仲健教授領(lǐng)銜完成，參與單位還包括臺灣成功大學(xué)、中國科學(xué)院植物所、比利時(shí)根特大學(xué)、深圳華大基因研究院、華南農業(yè)大學(xué)林學(xué)院等多個(gè)研究團隊。

　　種屬：川金絲猴(Rhinopithecus roxellana)

　　基因組：約3billionbp

　　中科院動(dòng)物研究所、中國科學(xué)院大學(xué)、北京諾禾致源(Novogene)公司的研究團隊測序和裝配了一只雄性川金絲猴的基因組，并將其與三個(gè)近緣物種進(jìn)行了比較。這一成果發(fā)表在十一月二日的NatureGenetics雜志上。研究人員發(fā)現，川金絲猴從脂肪酸獲取能量和降解外源物質(zhì)的能力得到了增強。這些信息可以幫助人們進(jìn)一步理解疣猴亞科的膳食適應和進(jìn)化史。

　　種屬：腸病毒D68(EV-D68)

　　過(guò)去幾個(gè)月，腸病毒D68令數百名美國兒童患病。華盛頓大學(xué)的研究人員測序和分析了腸病毒D68(EV-D68)的基因組，這一成果將發(fā)表在新一期的 Emerging Infectious Diseases雜志上。(Genome Sequence of Enterovirus D68 from St. Louis，Missouri，USA)

　　腸病毒D68(EV-D68)能在兒童中引起嚴重的呼吸道疾病。其基因組序列可以“幫助人們開(kāi)發(fā)更好的診斷測試，”共同作者GregoryStorch說(shuō)�！坝兄�于解釋病毒感染為什么會(huì )造成嚴重的疾病，以及EV-D68為什么比過(guò)去傳播得更廣�！�

　　種屬：蜈蚣(Strigamia maritima)

　　基因組：290millionbp

　　包括Baylor醫學(xué)院在內的國際團隊首次完成了多足類(lèi)動(dòng)物的基因組測序，一種生活在海邊的蜈蚣Strigamia maritima。這一成果發(fā)表在十一月二十五日的PLOS Biology雜志上。

　　S.maritima有毒而且生活在地下。研究人員認為，這種蜈蚣的基因組序列有助于日后研究多足類(lèi)動(dòng)物的進(jìn)化。

　　“它的一些基因可以為人們提供直接的幫助。蜈蚣能通過(guò)注射毒液使獵物麻痹，”文章的共同作者，劍橋大學(xué)的Michael Akam說(shuō)�！斑@種毒液的成分往往可以制成強力的藥物，蜈蚣基因組序列將幫助人們找到編碼這些成分的基因�！�

　　種屬：彈涂魚(yú)(Boleophthalmus pectinirostris、Scartelaos histophorus、Periophthalmodon schlosseri、P. magnuspinnatus)

　　基因組：平均827millionbp

　　彈涂魚(yú)又稱(chēng)跳跳魚(yú)，是世界上唯一一種能在陸地上活動(dòng)的魚(yú)類(lèi)。它們適應獨特的生境，生活在近海沿岸及河口高潮區以下的灘涂上或是咸淡水的交界處。彈涂魚(yú)既能在水中呼吸，也能在空氣中呼吸。

　　深圳華大基因研究院的科學(xué)家們對來(lái)自不同棲息地的四種彈涂魚(yú)進(jìn)行了基因組測序，這項研究發(fā)表在十二月二日的Nature Communications雜志上。研究顯示，彈涂魚(yú)的魚(yú)鰓中有關(guān)氨排泄的幾個(gè)基因經(jīng)歷了正向選擇，“表明它們對于彈涂魚(yú)耐受環(huán)境氨的能力很重要”。此外，研究人員還對彈涂魚(yú)的視覺(jué)相關(guān)基因進(jìn)行了研究。

　　脊椎動(dòng)物從水生向陸生過(guò)渡是一個(gè)重要的進(jìn)化事件，而彈涂魚(yú)基因組為此提供了寶貴的信息。